Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNA9Q9UGM1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms