Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSFQ9UBX1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms