Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLKQ9UBT6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLKQ9UBT6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms