Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVK-18Q9QC07 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms