Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VAPAQ9P0L0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPAQ9P0L0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms