Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
THUMPD1Q9NXG2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms