Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms