Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms