Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms