Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EMILIN3Q9NT22 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms