Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOMER3Q9NSC5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms