Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms