Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms