Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNTD2Q9H8S5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms