Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MIXL1Q9H2W2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms