Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00597Q9H2U6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00597Q9H2U6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms