Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLIRPQ9GZT3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms