Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms