Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCSER1Q9C0I3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCSER1Q9C0I3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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