Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NLRP1Q9C000 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NLRP1Q9C000 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms