Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TRIM54Q9BYV2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms