Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP5M1-202ENST00000431972 1815 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG2-206ENST00000398304 783 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512353.1-203ENST00000444563 610 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPA1P57-202ENST00000452488 958 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 LETM2-213ENST00000527710 1261 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011595.2-201ENST00000546640 1110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL691403.1-201ENST00000553510 678 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005476.2-201ENST00000555771 509 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 DSTYK-203ENST00000615388 1042 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC013652.1-201ENST00000560197 1378 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 PYHIN1-205ENST00000392254 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms