Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM5DQ9BY66 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM5DQ9BY66 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms