Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms