Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PACSIN1Q9BY11 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PACSIN1Q9BY11 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms