Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms