Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC106Q9BWC9 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC106Q9BWC9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms