Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KATNB1Q9BVA0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms