Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYT11Q9BT88 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms