Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF559Q9BR84 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms