Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LPIN3Q9BQK8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LPIN3Q9BQK8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms