Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD27Q96NW4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms