Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMTM3Q96MX0 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms