Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms