Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
UBE2E2Q96LR5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms