Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERAC1Q96JX3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERAC1Q96JX3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms