Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms