Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SMIM12Q96EX1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SMIM12Q96EX1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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