Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
APOBEC4Q8WW27 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms