Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms