Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HJURPQ8NCD3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms