Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms