Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STRCQ7RTU9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STRCQ7RTU9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms