Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTOP1Q7RTM1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms