Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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USP43Q70EL4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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USP43Q70EL4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP43Q70EL4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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