Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP31Q70CQ4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP31Q70CQ4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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