Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PDZRN4Q6ZMN7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZRN4Q6ZMN7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms