Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF7Q6Q0C0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF7Q6Q0C0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms