Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDC4Q6P2E9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDC4Q6P2E9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EDC4Q6P2E9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDC4Q6P2E9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EDC4Q6P2E9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
EDC4Q6P2E9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms