Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms